一、系所沿革
「中山醫學大學生物醫學科學學系」前身為「中山醫學大學生命科學系」。民國86年中山醫學院生命科學系成立，乃繼陽明大學及清華大學之後全國第三個成立之生命科學系。90學年度本校由「中山醫學院」改制為「中山醫學大學」。本系也從原先醫學院一員改隸屬於「醫學科技學院」。鑑於生命科學相關科系在全國各大學院校如雨後春筍般成立，且各有其發展背景及方向，為突顯本系結合基礎醫學、生物醫學及生物技術之辦學特色，經92學年度系務會議討論更改系名，報教育部核准於94學年度起正式更名為『生物醫學科學學系』，成為全國首先成立唯一的生物醫學科學學系。同時，為延續大學教育並培養具研發能力的人才，於94學年度成立「生物醫學科學學系碩士班」。

二、設立宗旨
本系(所)之設立源自學校基於國家對生物科技產業發展之重視，在本校醫學背景下，欲加強基礎醫學研究人才之培養並結合其在生物科技產業之應用。故無論師資延聘課程設計研究方向皆以基礎醫學、生物醫學及相關生物技術為主。而基礎醫學或生物醫學領域在生物科技的應用上無疑扮演舉足輕重的角色。結合此一世界潮流及本校醫學大學的背景，因而設立生物醫學科學系(所)，因而設立生物醫學科學學系(所)，培育相關人才。本系(所)設立宗旨在於培育具有基礎醫學、本系(所)設立宗旨在於培育具有基礎醫學、生物醫學及生物技術核心知識與能力的生命科學人才。